本會轄內之安平漁港為第一類漁港，另有第二類漁港四草漁港也隸屬本會轄區，西北鄰近澎湖、轄區海岸線綿長，由於鄰近台灣海峽漁場遼闊，漁業資源豐富，具有近海漁業之最佳天然條件，另有海上養殖蚵產業，是本島浮棚式養殖蚵產業最大區域，加上陸上魚塭面積廣闊，養殖虱目魚、台灣鯛、文蛤及各種高經濟價值魚類，供銷市場功能貢獻良多。其組織涵蓋全市六個行政區，會員數約32500人，其中以安南區、南區、安平區佔絕大多數，尤其年產魚貨運銷遍及全臺各大消費市場，對民生供需調節及繁榮漁村經濟助益頗鉅。
